《魔法老师 第二季》是由主演的一部动漫片，奈基虽然还只是一个十岁的少年，但是他已经是英国国立魔法学校的优秀毕业生了。以成为出色的魔法使为目标的奈基，为了完成毕业论文而来到麻帆良学园担任女子中等部二年A班的导师。刚来报道的第一天，温和的奈基就不幸的惹到了班上活泼脱线的女生神乐坂明日菜,虽然他小心翼翼的保守自己会使用魔法的秘密，但是一次为了救班上的图书管理员宮崎のどか同学，不小心被神乐坂明日菜看到，并且因为意外KISS而与之结下契约,成为魔法使从者。奈基和神乐坂明日菜等31位女生的笑闹校园生活从此揭开了序幕……